הניתוח השכיח בטיפול עבור גלאוקומה נקרא טרבקולקטומיה. הניתוח מבוצע לרב בהרדמה מקומית לעין. מטרת הניתוח להוריד את הלחץ התוך עיני במידה משמעותית, ולכן מבוצע בחולים עם לחץ גבוה למרות טיפול תרופתי בטיפות או כשהנזק מהמחלה מתקדם למרות טיפול שמרני.
מטרת הניתוח להגביר את ניקוז הנוזלים מתוך העין, על מנת להוריד לחץ תוך עיני . בניתוח יוצרים נתיב לניקוז נוזל העין, אשר מתנקז דרך חריר קטן אל מתחת לרקמת הלחמית . פתח הניקוז מכוסה ברקמת דופן העין ואינו חשוף לחוץ. הניתוח מבוצע לרב מתחת לעפעף העליון. לאחר הניתוח נוצרת תפיחות קלה של הלחמית העליונה, עקב זרימת הנוזל לאזור זה.
בניתוח ניתן להשתמש גם בחומר המונע את הצטלקות הרקמות במקום הניתוח (מיטומיצין C), ומאפשר המשך ניקוז יעיל של הנוזלים לאורך זמן.
ביום הניתוח מונחת תחבושת על העין. הביקורת הראשונה מבוצעת לרב למחרת הניתוח.
לאחר הניתוח מטפלים בטיפות להקטנת התהליך הדלקתי בעין ובטיפות אנטיביוטיות. הטיפול בטיפות מופסק בהדרגה.
במידה והלחץ לאחר הניתוח אינו נמוך דיו, ניתן להוסיף טיפול בטיפות להורדת הלחץ או להתיר תפרים במקום הניתוח. אפשרות טיפולית נוספת להורדת הלחץ בעין הינה הזרקה של חומר הנוגד היווצרות צלקת (5-FU) למקום הניתוח.
ניתוח הטרבקולקטומיה יעיל בהורדת הלחץ התוך עיני, אךעלולים להיות סיבוכים בעקבות הטיפול. הסיבוכים כוללים זיהום באזור הניתוח או זיהום תוך עיני, ירידה בראיה, בעיקר בחולים עם נזק קשה של המחלה, אי יציבות של הלחץ התוך עיני- לחץ נמוך מאד או גבוה, והאצה בהתפתחות והתקדמות קטרקט לאחר הניתוח.